Активисты МОО "Зеленый Фронт" и жители Красного Бора заявляют о стоках с полигона в реку Большая Ижорка. Обводной канал для сбора поверхностных и дренажных вод, соединенный с магистральным каналом "Красного Бора", имеет таким образом связь с рекой.
 
Как заявляют экологи, прямотоком все стекает без очистки в магистральный канал. На дне канала фиксируются отложения нефтепродуктов, а при механическом воздействии всплывает нефтяная пленка.
 
Данные факты свидетельствуют о наличии диффузного загрязнения -  дренирование захороненных в картах отходов в водоносный горизонт, то есть отмечается негативное влияние накопленных на полигоне отходов на поверхностные  и подземные воды.